論文 - 墨　智成

21. An Improved Model-potential-free Analysis of the Structure Factor Obtained from a Small-angle Scattering: Acquisitions of the Pair Distribution Function and the Pair Potential

    Ken-ichi Amano, Ryosuke Sawazumi, Hiroshi Imamura, Tomonari Sumi, Kota Hashimoto, Kazuhiro Fukami, Haru Kitaoka, Naoya Nishi, Tetsuo Sakka，Chemistry Letters，49巻，9号，(頁 1017 ～ 1021)，2020年09月

    

22. Is F1-ATPase a Rotary Motor with Nearly 100% Efficiency? Quantitative Analysis of Chemomechanical Coupling and Mechanical Slip

    Tomonari Sumi, Stefan Klumpp，Nano Letters，19巻，5号，(頁 3370 ～ 3378)，2019年05月

    

23. Interaction potential surface between Raman scattering enhancing nanoparticles conjugated with a functional copolymer

    Takeshi Morita, Yuki Ogawa, Hiroshi Imamura, Kouki Ookubo, Nobuo Uehara, Tomonari Sumi，Phys. Chem. Chem. Phys.，21巻，31号，(頁 16889 ～ 16894)，2019年05月

    

24. Theoretical analysis on thermodynamic stability of chignolin

    Tomonari Sumi, Kenichiro Koga，Scientific Reports，9巻，(頁 5186-1 ～ 5186-9)，2019年03月

    

25. Tracing whale myoglobin evolution by resurrecting ancient proteins

    Yasuhiro Isogai, Hiroshi Imamura, Setsu Nakae, Tomonari Sumi, Ken-ichi Takahashi, Taro Nakagawa, Antonio Tsuneshige, Tsuyoshi Shirai，Scientific Reports，8巻，(頁 16883-1 ～ 16883-14)，2018年11月

    

26. Application of reference-modified density functional theory: Temperature and pressure dependences of solvation free energy

    Tomonari Sumi, Yutaka Maruyama, Ayori Mitsutake, Kenji Mochizuki, Kenichiro Koga，JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY，39巻，4号，(頁 202 ～ 216)，2018年02月

    

27. Numerical calculation on a two-step subdiffusion behavior of lateral protein movement in plasma membranes

    Tomonari Sumi, Atsushi Okumoto, Hitoshi Goto, Hideo Sekino，PHYSICAL REVIEW E，96巻，4号，(頁 042410-1 ～ 042410-10)，2017年10月

    

28. Myosin V: Chemomechanical-coupling ratchet with load-induced mechanical slip

    Tomonari Sumi，Scientific Reports，7巻，(頁 13489-1 ～ 13489-12)，2017年10月

    

29. Influence of co-non-solvency on hydrophobic molecules driven by excluded volume effect

    Kenji Mochizuki, Tomonari Sumi, Kenichiro Koga，PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS，19巻，35号，(頁 23915 ～ 23918)，2017年09月

    

30. Design principles governing chemomechanical coupling of kinesin

    Tomonari Sumi，Scientific Reports，7巻，(頁 1163-1 ～ 1163-13)，2017年04月

    

31. Hydrophobic Polymer Chain in Water That Undergoes a Coil-to-Globule Transition Near Room Temperature

    I. Hatano, K. Mochizuki, T. Sumi, K. Koga，JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B，120巻，47号，(頁 12127 ～ 12134)，2016年12月

    

32. Interaction Potential between Biological Sensing Nanoparticles Determined by Combining Small-Angle X-ray Scattering and Model-Potential-Free Liquid Theory

    Takeshi Morita, Nobuo Uehara, Kenji Kuwahata, Hiroshi Imamura, Takeshi Shimada, Kouki Ookubo, Maki Fujita, Tomonari Sumi，J. Phys. Chem. C，120巻，44号，(頁 25564 ～ 25571)，2016年11月

    

33. A reference-modified density functional theory: An application to solvation free-energy calculations for a Lennard-Jones solution

    Tomonari Sumi, Yutaka Maruyama, Ayori Mitsutake, Kenichiro Koga，THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS，144巻，22号，(頁 224104-1 ～ 224104-15)，2016年06月

    

34. Liquid-iquid phase separation of N-isopropylpropionamide aqueous solutions above the lower critical solution temperature

    Kenji Mochizuki, Tomonari Sumi, Kenichiro Koga，Scientific Reports，6巻，(頁 24657-1 ～ 24657-10)，2016年04月

    

35. Mean-Field Approximation to the Hydrophobic Hydration in the Liquid-Vapor Interface of Water

    Kiharu Abe, Tomonari Sumi, Kenichiro Koga，J. Phys. Chem. B，120巻，8号，(頁 2012 ～ 2019)，2016年03月

    

36. Driving forces for the pressure-induced aggregation of poly(N-isopropylacrylamide) in water

    Kenji Mochizuki, Tomonari Sumi, Kenichiro Koga，PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS，18巻，6号，(頁 4697 ～ 4703)，2016年02月

    

37. Investigation of a virtual nested two-dimensional lattice model for representing the diffusive motion of a transmembrane protein in cell membrane

    Atsushi OKUMOTO, Tomonari SUMI, Hideo SEKINO, Hitoshi GOTO，Journal of Computer Chemistry, Japan，15巻，6号，(頁 229 ～ 231)，2016年

    

38. Erratum: "A solvation-Free-Energy Functional: A Reference-Modified Density Functional Formulation" [J. Comput. Chem. 2015, 36, 1359-1369]

    Tomonari Sumi, Ayori Mitsutake, Yutaka Maruyama，J. Comput. Chem.，36巻，26号，(頁 2009 ～ 2011)，2015年10月

    

39. A solvation-free-energy functional: A reference-modified density functional formulation

    Tomonari Sumi, Ayori Mitsutake, Yutaka Maruyama，JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY，36巻，18号，(頁 1359 ～ 1369)，2015年07月

    

40. A model-free method for extracting interaction potential between protein molecules using small-angle X-ray scattering

    Tomonari Sumi, Hiroshi Imamura, Takeshi Morita, Keiko Nishikawa，JOURNAL OF MOLECULAR LIQUIDS，200巻，(頁 42 ～ 46)，2014年12月